Shaytan, Alexey K.: шукати на сайті Z-Library

Пожертвування 15 вересня 2024 – 1 жовтня 2024 Про збір коштів

Найбільша колекція наукових статей у сіті. 70,000,000+ безкоштовних статей.

Пожертвування 15 вересня 2024 – 1 жовтня 2024

Z-Library - одна з найбільших онлайн-бібліотек у світі, в якій зберігається більше 17,000,000 книг та 84,837,000 статей. Ми намагаємось зробити літературу доступною кожному. Сьогодні (15 вересня 2024) ми відкриваємо додатковий збір пожертвувань на підтримку та розвиток проекту.

Також БЕЗЛІМТНІ завантаження (протягом 31 дня після завершення пожертвування) доступні для ВСІХ користувачів, які підтримають проект в період збору коштів до 1 жовтня 2024.

Про збір коштів Детальніше

Підтримати

Книги
Статті (32)
Найпопулярніші
Перелік
- Перелік
- Таблиця

1

HistoneDB 2.0: a histone database with variants—an integrated resource to explore histones and their variants

Draizen, Eli J., Shaytan, Alexey K., Mariño-Ramírez, Leonardo, Talbert, Paul B., Landsman, David, Panchenko, Anna R.

Журнал:

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 1015 KB

english, 2016

2

Large-scale ATP-independent nucleosome unfolding by a histone chaperone

Valieva, Maria E, Armeev, Grigoriy A, Kudryashova, Kseniya S, Gerasimova, Nadezhda S, Shaytan, Alexey K, Kulaeva, Olga I, McCullough, Laura L, Formosa, Tim, Georgiev, Pavel G, Kirpichnikov, Mikhail P,

Журнал:

Nature Structural and Molecular Biology

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.34 MB

english, 2016

3

Free energy profiles of amino acid side chain analogs near water-vapor interface obtained via MD simulations

Alexey K. Shaytan, Victor A. Ivanov, Konstantin V. Shaitan, Alexei R. Khokhlov

Журнал:

Journal of Computational Chemistry

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 822 KB

english, 2010

4

Solvent Accessible Surface Area of Amino Acid Residues in Globular Proteins: Correlation of Apparent Transfer Free Energies with Experimental Hydrophobicity Scales

Shaytan, Alexey K., Shaitan, Konstantin V., Khokhlov, Alexei R.

Журнал:

Biomacromolecules

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.86 MB

english, 2009

5

Peptide nanofibrils boost retroviral gene transfer and provide a rapid means for concentrating viruses

Yolamanova, Maral, Meier, Christoph, Shaytan, Alexey K., Vas, Virag, Bertoncini, Carlos W., Arnold, Franziska, Zirafi, Onofrio, Usmani, Shariq M., Müller, Janis A., Sauter, Daniel, Goffinet, Christine

Журнал:

Nature Nanotechnology

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 5.22 MB

english, 2013

6

Self-Assembling Nanofibers from Thiophene–Peptide Diblock Oligomers: A Combined Experimental and Computer Simulations Study

Shaytan, Alexey K., Schillinger, Eva-Kathrin, Khalatur, Pavel G., Mena-Osteritz, Elena, Hentschel, Jens, Börner, Hans G., Bäuerle, Peter, Khokhlov, Alexei R.

Журнал:

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 5.18 MB

english, 2011

7

Pausing as a mechanism of nucleosome recovery

Han-Wen Chang, Olga I Kulaeva, Alexey Shaytan, M Kibanov…

Журнал:

Epigenetics & Chromatin

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 82 KB

english, 2013

8

Large-scale atomistic simulation of a nanosized fibril formed by thiophene–peptide “molecular chimeras”

Shaytan, Alexey K., Khokhlov, Alexei R., Khalatur, Pavel G.

Журнал:

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 389 KB

english, 2010

9

Investigation of Ion Permeation through the Cx26 Hemichannel

Kasimova, Marina, Shaytan, Alexey, Shaitan, Konstantin, Tarek, Mounir

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 43 KB

english, 2014

10

Voltage-gated ion channel modulation by lipids: Insights from molecular dynamics simulations

Kasimova, Marina A., Tarek, Mounir, Shaytan, Alexey K., Shaitan, Konstantin V., Delemotte, Lucie

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.43 MB

english, 2014

11

Molecular Insights into Electroporation and Electrotransfer through Model Cell Membranes

Kasimova, Marina, Delemotte, Lucie, Polak, Andraz, Miklavcic, Damijan, Casciola, Maura, Apollonio, Francesca, Breton, Marie, Mir, Luis, Shaytan, Alexey, Shaitan, Konstantin, Tarek, Mounir

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 42 KB

english, 2014

12

Direct prediction of residual dipolar couplings of small molecules in a stretched gel by stochastic molecular dynamics simulations

Frank, Andreas O., Freudenberger, J. Christoph, Shaytan, Alexey K., Kessler, Horst, Luy, Burkhard

Журнал:

Magnetic Resonance in Chemistry

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 803 KB

english, 2015

13

Nucleosome adaptability conferred by sequence and structural variations in histone H2A–H2B dimers

Shaytan, Alexey K, Landsman, David, Panchenko, Anna R

Журнал:

Current Opinion in Structural Biology

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.33 MB

english, 2015

14

Physicochemical mechanisms of protein regulation by phosphorylation

Nishi, Hafumi, Shaytan, Alexey, Panchenko, Anna R.

Журнал:

Frontiers in Genetics

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.93 MB

english, 2014

15

Structural Perspectives on the Evolutionary Expansion of Unique Protein-Protein Binding Sites

Goncearenco, Alexander, Shaytan, Alexey K., Shoemaker, Benjamin A., Panchenko, Anna R.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.23 MB

english, 2015

16

Structural analysis of nucleosomal barrier to transcription

Gaykalova, Daria A., Kulaeva, Olga I., Volokh, Olesya, Shaytan, Alexey K., Hsieh, Fu-Kai, Kirpichnikov, Mikhail P., Sokolova, Olga S., Studitsky, Vasily M.

Журнал:

Proceedings of the National Academy of Sciences

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.71 MB

english, 2015

17

6 Combined influence of linker DNA and histone tails on nucleosome dynamics as revealed by microsecond molecular dynamics simulations

Shaytan, Alexey K., Armeev, Grigoriy A., Goncearenco, Alexander, Zhurkin, Victor B., Landsman, David, Panchenko, Anna R.

Журнал:

Journal of Biomolecular Structure and Dynamics

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 534 KB

english, 2015

18

Coupling between histone conformations and DNA geometry in nucleosomes on a microsecond timescale: atomistic insights into nucleosome functions

Shaytan, Alexey K., Armeev, Grigoriy A., Goncearenco, Alexander, Zhurkin, Victor B., Landsman, David, Panchenko, Anna R.

Журнал:

Journal of Molecular Biology

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.18 MB

english, 2015

19

Polymorphism of Histone Tail Interactions in Nucleosome

Shaytan, Alexey K., Armeev, Grigory A., Zhurkin, Victor B., Landsman, David, Panchenko, Anna R.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 41 KB

english, 2015

20

Trajectories of microsecond molecular dynamics simulations of nucleosomes and nucleosome core particles

Shaytan, Alexey K., Armeev, Grigoriy A., Goncearenco, Alexander, Zhurkin, Victor B., Landsman, David, Panchenko, Anna R.

Журнал:

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 144 KB

english, 2016

21

Nucleosome Dynamics at Microsecond Timescale: DNA-Protein Interactions, Water-Mediated Interactions and Nucleosome Formation

Shaytan, Alexey K., Armeev, Grigory A., Goncearenco, Alexander, Zhurkin, Victor B., Landsman, David, Panchenko, Anna R.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 43 KB

english, 2016

22

Genomic profiling of multiple sequentially acquired tumor metastatic sites from an 'exceptional responder' lung adenocarcinoma patient reveals extensive genomic heterogeneity and novel somatic variants driving treatment response

Biswas, Romi, Gao, Shaojian, Cultraro, Constance M., Maity, Tapan K., Venugopalan, Abhilash, Abdullaev, Zied, Shaytan, Alexey, Carter, Corey A., Thomas, Anish, Rajan, Arun, Song, Young, Pitts, Stephan

Журнал:

Molecular Case Studies

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 4.26 MB

english, 2016

23

MS_HistoneDB, a manually curated resource for proteomic analysis of human and mouse histones

Sara El Kennani,Annie Adrait,Alexey K. Shaytan,Saadi Khochbin…

Журнал:

Epigenetics & Chromatin

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.42 MB

english, 2017

24

Molecular basis of CENP-C association with the CENP-A nucleosome at yeast centromeres

Xiao, Hua, Wang, Feng, Wisniewski, Jan, Shaytan, Alexey K., Ghirlando, Rodolfo, FitzGerald, Peter C., Huang, Yingzi, Wei, Debbie, Li, Shipeng, Landsman, David, Panchenko, Anna R., Wu, Carl

Журнал:

Genes & Development

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 16.71 MB

english, 2017

25

Hydroxyl-radical footprinting combined with molecular modeling identifies unique features of DNA conformation and nucleosome positioning

Shaytan, Alexey K., Xiao, Hua, Armeev, Grigoriy A., Wu, Carl, Landsman, David, Panchenko, Anna R.

Журнал:

Nucleic Acids Research

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 4.69 MB

english, 2017

26

Self-organizing bioinspired oligothiophene–oligopeptide hybrids

Shaytan, Alexey K, Schillinger, Eva-Kathrin, Mena-Osteritz, Elena, Schmid, Sylvia, Khalatur, Pavel G, Bäuerle, Peter, Khokhlov, Alexei R

Журнал:

Beilstein Journal of Nanotechnology

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 7.25 MB

english, 2011

27

Structural interpretation of DNA–protein hydroxyl-radical footprinting experiments with high resolution using HYDROID

Shaytan, Alexey K., Xiao, Hua, Armeev, Grigoriy A., Gaykalova, Daria A., Komarova, Galina A., Wu, Carl, Studitsky, Vasily M., Landsman, David, Panchenko, Anna R.

Журнал:

Nature Protocols

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.18 MB

english, 2018

28

Linking chromatin composition and structural dynamics at the nucleosome level

Armeev, Grigoriy A, Gribkova, Anna K, Pospelova, Iunona, Komarova, Galina A, Shaytan, Alexey K

Журнал:

Current Opinion in Structural Biology

Рік:

2019

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.49 MB

english, 2019

29

Histone Octamer Structure Is Altered Early in ISW2 ATP-Dependent Nucleosome Remodeling

Hada, Arjan, Hota, Swetansu K., Luo, Jie, Lin, Yuan-chi, Kale, Seyit, Shaytan, Alexey K., Bhardwaj, Saurabh K., Persinger, Jim, Ranish, Jeff, Panchenko, Anna R., Bartholomew, Blaine

Журнал:

Рік:

2019

Мова:

english

Файл:

PDF, 6.29 MB

english, 2019

30

Analyzing Nucleosome Plasticity via Atomistic MD Simulations

Kniazeva, Anastasiia, Armeev, Grigorii, Pospelova, Iunona, Shaytan, Alexey K.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2020

Файл:

PDF, 41 KB

2020

31

Integrative Modeling of Nucleosomes and Supranucleosomal Structures

Armeev, Grigoriy, Panchenko, Anna, Feofanov, Alexey, Shaytan, Alexey K.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2020

Файл:

PDF, 38 KB

2020

32

Detecting Cas9-sgRNA Complex Interactions with DNA via Fluorescent Microscopy: Computer Simulations of Experimental Designs

Novikov, Roman, Armeev, Grigoriy, Gribkova, Anna, Kacher, Julia, Gluhov, Grigory, Shaytan, Alexey

Журнал:

Microscopy and Microanalysis

Рік:

2020

Файл:

PDF, 405 KB

2020